第二集中，尼(😍)奥(ào )(💠)（基(jī )努(nǔ )(🏯)·里维斯 Keanu Reeves 饰(shì )）没有(yǒu )能从内(nèi )部(bù )摧毁“母体”，他的身(⛏)体在(👪)真实(🤷)世(shì )界的(de )飞(fēi )船上(💹)陷于(🐩)昏(hūn )迷(mí )，思想却被困在介(🤔)于“母体”和真(🔤)实(shí )世界的中(🔷)间地带，这个地方由(🏴)“火车人”控制(👄)。墨菲(fēi )斯（劳伦斯·菲(⏳)什(shí )伯恩 Laurence Fishburne 饰）(✖)和崔妮蒂（凯(🚩)瑞-安·(❄)莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）等人知(✒)道了(🈸)尼奥的(🛌)情况，在(🚓)守护天使(👆)的带领(lǐng )下， 找到了“火车人”的控制(👔)者(zhě )梅罗纹(wén )奇，经过(🍏)一番激(jī )斗，将尼奥救了出来。此时，电(🏃)子乌贼(zéi )部队(🍄)对锡安发起了猛烈(💃)的(de )攻击，人类组(zǔ )织所有机甲(🔝)战士展(zhǎn )开顽强的抵抗，形(👑)势(shì )危在(zài )旦(dàn )夕(xī )；(🥩)尼(ní )奥和(hé )崔(cuī )妮蒂驾驶了(le )一艘飞船克服重重困难，到(💽)达机器城市(shì )，尼(📮)奥(ào )(📊)终(📂)于见到了机器世(👄)界的统(💁)治者“机器大(dà )帝”，双方谈(🥤)判(🎑)并达成了协(😞)议：尼奥除掉(diào )不(😓)受“母体”控(🔀)制的史密斯，以换取锡安(ān )的和(hé )平(píng )。在“母(mǔ )体(tǐ )”中，尼奥(🍉)和史密(🌭)斯(sī )展(zhǎn )开(kāi )了关系人(rén )类生(shēng )(🔙)死存亡(wáng )的最后决斗。